Vamos a hablar de respuestas fisiopatológicas asociadas a la disbiosis. Podemos encontrar daño a nivel de la mucosa digestiva, por ejemplo, en la estomatitis aftosa recurrente, se ha encontrado un alteración de la microbiota tanto a nivel de la mucosa, como a nivel de la saliva. Especialmente por el uso de azúcares, de carbohidratos, por la mala limpieza o por el empleo de saborizantes artificiales.

La función inmune de la mucosa tiene una clara relación con la vitamina D.